Penelitian ini menggunakan tiga macam pembiayaan bermasalah yang memiliki karakteristik dan porsi yang berbeda dalam mempengaruhi profitabilitas melalui Return On Asset KSPPS BMT MitraMu Jepara. Karena Return On Asset digunakan untuk mengukur efektifitas perusahaan di dalam menghasilkan keuntungan dengan memanfaatkan aktiva yang dimilikinya. Ketiga macam pembiayaan bermasalah yang dimaksud ialah pembiayaan bermasalah murabahah, pembiayaan bermasalah mudharabah dan pembiayaan bermasalah ijarah. Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dimana data penelitian yang didapatkan berupa angka-angka dan analisis menggunakan statistik. Dalam penelitian ini menggunakan tiga variabel bebas dan satu variabel terikat. Teknik analisis yang digunakan adalah teknik analisis data statistik regresi ganda dengan menggunakan alat SPSS 21. Hasil dari analisis secara parsial menunjukkan bahwa pembiayaan bermasalah murabahah berpengaruh negatif namun tidak signifikan terhadap tingkat profitabilitas, pembiayaan bermasalah mudharabah berpengaruh negatif signifikan terhadap profitabilitas, sedangkan pembiayaan bermasalah ijarah tidak berpengaruh terhadap tingkat profitabilitas. Secara simultan pembiayaan bermasalah murabahah, mudharabah dan ijarah berpengaruh signifikan terhadap profitabilitas KSPPS BMT MitraMu Jepara.