Penelitian di lakukan untuk mengetahui dan menguji secara empiris pengaruh penerapan sistem akuntansi pemerintah daerah, pengendalian intern, dan sistem pelaporan terhadap akuntabilitas kinerja instansi pemerintah pada Kabupaten Jepara. Dalam rangaka meningkatkan pelayanan, pemerintah terdorong untuk memberikan prtanggungjawaban kinerja pada publik berupa Laporan akuntabilitas , untuk mempertanggungjawabkan hasil dari kinerja dari organisasi perangkat daerah, Oleh karena itu, laporan akuntabilitas harus disajikan secara transparan serta memiliki nilai informasi keuangan yang bernilai dan bebas dari salah saji.
Populasi dalam penelitian ini adalah OPD Kabupaten Jepara. Pemilihan sampel dengan metode sampling jennuh, dengan jumlah responden 82. Data yang digunakan dalam penelitian ini berupa data primer. Teknik pengumpulan data dengan teknik survei dengan menyebarkan kuesioner kepada masing-masing OPD Kabupaten Jepara. Metode analisis yang digunakan adalah analisis regresi berganda dengan bantuan Statistical Package For Social Science 22 (SPSS 22).
Berdasarkan hasil analisis yang dilakukan maka diperoleh kesimpulan bahwa secara parsial penerapan sistem akuntansi pemerintah daerah berpengaruh terhadap akuntabilitas kinerja instansi pemerintah, sedangkan pengendalian intern dan sistem pelaporan tidak berpengaruh terhadap akuntabilitas kinerja instansi pemerintah. Secara simultan penerapan sistem akuntansi pemerintah daerah pengendalian intern dan sistem pelaporan berpengaruh signifikan terhadap Akuntabilitas kinerja instansi pemerintah pada Kabupaten Jepara.